W ramach 5 Programu Ramowego UE Instytut uzyskał dwa Centra doskonałości:
Sol-Gel Materials and Nanotechnology Center of Excellence (SGM&N)
Koordynator: prof. Krzysztof Maruszewski
Zakres działalności: Technikka Zol-Żel, Materiały Zol-Żelowe, proszki magnetyczne, czujniki optyczne
Centrum Doskonałości Recyklingu Materiałów (MARECEX)
Koordynator: prof. Marek Kozłowski
Zakres działalności: przyjazna środowisku elektronika, recykling w przemyśle samochodowym, materiały polimerowe i ich recykling, recyklinng materiałów wybuchowych
Centra Doskonałości to jednostki bądź struktury organizacyjne, skupiające zespoły uczonych o wybitnych osiągnięciach badawczych, którzy współpracują w zakresie wspólnych tematów o dużym znaczeniu dla gospodarki kraju, prowadzące badania naukowe i rozwijające nowoczesne technologie na poziomie światowym w sensie mierzalnych efektów naukowych (włączając działania szkoleniowe).